De nouvelles voûtes en pierre sont construites dans le choeur et le transept, plusieurs mètres plus bas que les anciennes voûtes. C'est à cause de cet abaissement que la rosace touche pratiquement l'ogive dessinée sur le mur, alors qu'autrefois un large espace subsistait au dessus.
C'est du XVe siècle également que datent trois statues : Notre Dame de Paimpont dans la nef, et St Judicaël et St Méen dans la chapelle nord. Au pied des statues de St Judicaël et St Méen, l'abbé Olivier Guiho qui restaura l'abbaye.
